现在的富士山顶上有浅间大社奥宫。在富士山八合目以上，除去登山道和气象观测所之外的385万平方米土地，都属于该神社所有。浅间神社的祭祀对象是美女神木花开耶姬，但实际上是把这位美女神作为富士山的神体来祭祀的。日本国内现有浅间神社1300家。从浅间神社的历史来看，802年恒武天皇的时代，富士山火山爆发。惊恐万状的人们拼死举行镇火的祭祀。第二年好不容易停止了喷火，富士山变得安泰。为了感谢诸神，便于806年在山顶上建造了浅间神社。取浅间山的山名。浅间的发音为“ASAMA”，意味恐惧。原本的浅间信仰是以神道神社为根本的，但后来也融合了佛教与修验道，建造了大日寺等寺院。表现了日本人对宗教宽容的一面。而视富士山为神或佛的所在地，则表现出了日本人敬仰富士山的信仰特色。并具有与自己的人生重叠的意义。

在民间信仰中，富士山还是吉祥的象征。在日本，每年1月2日做的梦被称为“初梦”。初梦可以占卜一年的吉凶，这一习俗至今仍在日本流传。日本人认为如果能在初梦里梦见富士山，那是最大的吉兆。此外，在日本还有“初富士”的说法，也就是说在1月3日从日本桥眺望富士山。

总之，富士信仰融合了神道、佛教、道教（修验道）和民间信仰等各种要素，所有这些都反映出富士山和日本人心灵的深厚渊源。

《国镇记》里除去倒映的富士山之外，介绍了14座以富士冠名的山。《国镇记》里没有记载的还有很多。如指代北海道羊蹄山的虾夷富士就是其中之一。这座成层山与富士山有着同样优美的圆锥形状。被视为“北海第一奇观”。过去经常与富士混淆。同样是一座山，由于眺望的位置不同，名称也就不同。如横跨山形县和秋田县的鸟海山，山形县这边叫出羽富士，秋田县那边叫秋田富士。横跨岛根县和鸟取县的大山，岛根县这边叫出云富士，鸟取县那边叫伯耆富士。再如福井县最西端的青叶山，被称为永远禁止女人的山，以前曾分界于若狭国和丹后国。为此若狭这边叫若狭富士，丹后那边叫舞鹤富士。

为了成为日本的象征，很多日本企业特将自己的产品冠上富士的名字。如富士胶卷、富士玻璃、富士急行、富士电视台、富士通、富士电机、富士自行车等。此外，据统计，日本人姓“富士山”的有17户人家，它在日本人的姓氏排列中占第39549位。姓“富士”的有362户，占第6479位。如取名叫“富士男”、“富士子”的也为数不少。更为引人注目的是，大藏省在1984年印刷的5000日元纸币，以及2004年以后印刷的1000日元纸币的背面，都使用了富士山的画面。