在四川省甘孜州新龙县雄龙乡瓦琼寺保存了一套完整的手抄本，这个手抄本是西藏自治区那曲地方有一位霍尔王——仲那登巴送给瓦琼寺伏藏法王松昂尼巴的。

公元1870年左右松昂尼巴把手抄本的《甘珠尔》请到新龙并保留至今。后来本教学者阿雍仁波切将其影印出版，显宗六十三部，般若六十七部，密宗二十部，心宗七部。

后来本波密宗大师满金拉色仁波切花了五年的时间，将全部经书逐页修复，终于1998年将其重新编辑成一百七十八部。

甘珠尔的分类：

《甘珠尔》的目录编制方法分类较多，但一般分为四类：

1、言圆满之经部，总68卷63品。

2、广大清净之品部（般若部），总67卷67品。

3、深道密宗之续部，总18卷20品。

4、无上心品之库藏部，总7卷7品。

丹珠尔

从辛饶弥沃的法子穆确邓珠至今，象雄、印度、汉区、藏区、木雅等雍仲本教学者着写辛饶弥沃遗训释疏的论文称名《丹珠尔》。

《丹珠尔》也可以分显宗、密宗、心宗与大圆满，共有上千部。西藏那曲本教活佛丹巴尼玛出于抢救藏族古代文献的强烈责任感，经五年的辛勤收集，终于收集到三百八十部，于1999年出版了藏族历史上第一部本教大藏经《丹珠尔》。丹巴尼玛活佛没有出版的本波教《丹珠尔》还有五百多部。

雍仲本波佛教《甘珠尔》和《丹珠尔》是青藏高原本土宗教的大藏经。远在印度佛教传入之前，它就产生于西藏，并成为当地民众唯一信仰的宗教大藏经。它们包括藏地的文化习俗，心理素质、思维方式和行为规范，原始历史、科学、天文学、艺术、生命学、医术学、佛教学文等教理深奥。

汉译工程

2013年7月20日，中国社会科学院社会发展研究中心重点课题“古象雄文明探源”暨古象雄佛法大藏经汉译工程在北京启动。有着西藏古代社会“百科全书”之称的大藏经《甘珠尔》汉译工程，将由该中心和西藏昌都孜珠寺联合推进，计划十年完成。

中国首次启动大藏经《甘珠尔》的汉译工程，不仅将解密雪域高原的古象雄文明，还将探源古中国与古印度、古波斯，甚至与古希腊之间文明及文化互相影响、融合的历史。

“它是几千年古西藏文明的源头活水，一代代传承下来的‘活化石’，是远古各文化之间的亲情链条。”此次大藏经《甘珠尔》的主导译师——中国佛协理事、雍仲本教西藏昌都孜珠寺第四十三代法嗣丁真俄色活佛告诉记者。