孙策忽然看见于吉在屋门内出现，拔出剑想要砍于吉，结果孙策自己反倒倒在地上。众人把他救进卧室，他昏迷不醒。孙策的母亲吴夫人前来探望病情。不一会儿孙策苏醒过来，说起于吉的事。母亲说：“我的儿子冤枉地杀了神仙，才导致招来灾祸。”孙策笑着说：“我从十六七岁就跟随父亲出征，杀人多得像麻一样，不管是贤能的还是愚笨的不知道有多少，哪里有因为这个而遭祸的道理？现在杀了这个妖人，是为了杜绝大灾祸，有什么值得害怕的呢！”母亲说：“因为你不相信，所以才会这样，你可以做些好事来祈祷消灾。”孙策说：“我的命由天定，妖人怎么能带来灾祸呢？”母亲劝说他他也不醒悟，自己命令身边的人暗中做好事来保佑他。
这天夜里二更的时候，孙策躺在房间内，忽然阴风猛然刮起，把灯吹灭后又重新亮起；在灯影之下，看见于吉站在床前。孙策靠着床头，拿着剑掷向于吉，发出铮铮的声响。孙策大声呵斥说：“我生平发誓要诛杀妖邪虚妄之人，来使天下清净！你作为阴间的鬼魂，怎么敢靠近我！”说完，于吉忽然就不见了。
他的母亲听到这些事，转而心生烦恼。孙策于是带病勉强起身行动，来宽慰母亲的心。母亲看到孙策日渐脸色发黄身体消瘦，转而请求举行设斋祭祀来祈祷消灾。孙策听说后，就对母亲说：“孩儿自幼跟随父亲在四方纵横，不曾见过父亲敬重相信鬼神，母亲为什么要用谄媚的方式来对待这些事呢？”母亲说：“不是这样的。凡是人生活在天地之间，谁能没有死呢？只是要分清清浊罢了。禀受清气的，英灵魂魄不会消散，升入天上成为神；禀受浊气的，幽暗的魂魄不会消散，进入地下成为鬼。圣人尚且说：‘鬼神作为一种品德，它是很盛大的啊！’又说：‘向上下的神只祈祷吧。’鬼神的事情，不可不相信。你委屈迫害了神仙，难道会没有报应吗？我已经让人在郡里的玉清观内设斋，你可以亲自前去谢罪，自然就会平安了。”
孙策不敢违背母亲的命令，于是上轿来到道观。道士们出来迎接，孙策心里不高兴，勉强进入观内。道士请孙策焚香，孙策只是焚香却不道歉。忽然香炉中的烟升起不消散，结成伞盖的形状，在伞盖之上站着于吉。孙策看见后，急忙离开殿宇，走到走廊下就跑。走了不到几十步，又看见于吉站在面前，孙策拔出随从所佩戴的剑就砍。有一个人中剑倒下。众人一看，正是前几天下手杀于吉的人，剑插入脑袋，七窍里迸出鲜血而死。孙策让人抬出去埋葬。等到出关的时候，于吉又挡在观门之前。众人都看不见，只有孙策能看见。孙策说：“这道观就是妖人所在的地方！”坐在观前，随即召唤五百武士拆毁这座道观。武士上房揭瓦，都坠落在地。只有孙策看见房上站着于吉，用手去推他。孙策更加恼怒，命令武士一起放火，烧毁观宇。在火光中，看见于吉飞着瓦片投掷过来。
孙策急忙回到府中，又看见于吉在府前。孙策于是不进府，就点起三万军马，在城外驻扎野寨。孙策夜晚睡在中军帐中，命令武士各自手执长戈大斧，环绕帐篷站立。这一夜，唯独看见于吉披散着头发前来。孙策在帐中呵斥到天亮，如同癫狂如同醉酒。第二天急忙回到城内，在城门内又看见于吉，孙策不管不顾就回府。他的母亲因为随从的人都把这些事全说了，哭泣不停。这一夜，孙策看见于吉几十次，眼睛都不能合上。等到天亮，母亲到来，看见孙策极其瘦弱，母亲说：“儿子的模样完全变了啊！”孙策让人拿镜子来照，看见自己的模样，自己也觉得吃惊，回头看着左右的人说：“脸色变成这样，还怎么再建立功业呢？”忽然看见于吉站在镜子中，孙策拍打镜子，大叫一声：“妖人”，伤口崩裂，昏死过去。
母亲让人把他扶进卧房内。不一会儿孙策醒来，看见伤口完全破裂，于是自己叹息说：“我不能再活了！”随即请张昭等诸位将领都进来，孙策嘱咐说：“中原正乱，凭借吴、越的民众，三江的险固，足以观察成败。你们要好生辅佐我的弟弟！”于是取出印绶，叫弟弟孙权靠近卧榻边说：“如果统领江东的部众，在两军阵前决定战机，与天下争雄，你不如我；举荐贤能，让他们各自尽心力来保住江东，我不如你。你应当想想父兄创业的艰难，不要轻率行事！”孙权拜受印绶。孙策对母亲说：“不孝的儿子，寿命已尽，不能侍奉慈母了；现在把印绶交给弟弟孙权，希望母亲早晚教导他。父亲和兄长的旧部，千万不要轻视怠慢。”母亲于是放声大哭说：“担心你弟弟年幼，不能成事，那又该怎么办？”孙策说：“我的弟弟胜过我十倍，江东必然不会有闪失。只是内部事务不能决断，可以问张昭；外部事务不能决断，可以问周瑜。遗憾周瑜不在身边，不能嘱托他了！”叫来诸位弟弟说：“我死之后，你们可以听从孙权的使唤。宗族中如果有产生异心的人，众人都要斩杀他。骨肉叛逆，不能进入祖坟迁葬。”叫妻子大乔说：“我和你不幸，中途分开。早晚你妹妹如果进来拜见时，可以嘱托教导她对周瑜说，让他在意辅佐我的弟弟，不要辜负我平生登堂拜见母亲、两家通好的情义。”孙策又召集文武官员说：“你们要好好辅佐我的弟弟，保全忠义的名声。”再次对孙权说：“你如果辜负功臣，我在九泉之下的阴魂，必定不会与你相见。”嘱咐完毕就去世了，当时年仅二十六岁。史官有诗赞道：
独战东南角，人称“小霸王”。运筹如虎踞，决策似鹰扬。
威震三江静，名闻四海香。临终遗大事，应是识周郎。
曾固有诗说：
兵跨三江敢战争，民连六郡喜安宁。
光辉寒日金盔重，血染秋波宝剑腥。
眼阔尚嫌天地小，心高不信鬼神灵。
疑诛于吉浑闲事，只恨东南落将星！