虽然阿尔萨斯打败了他目前的所有敌人，但他却摆脱不了克尔苏加德的鬼魂。鬼魂告诉阿尔萨斯，为了巫妖王的下一步计划，他必须复活，方法就是把他的尸骨带到高等精灵王国奎尔萨拉斯的太阳之井去。
阿尔萨斯和亡灵天灾侵入奎尔萨拉斯，将精灵围困在脆弱的防线后。银月城的游侠领袖希尔瓦娜斯·风行者奋勇战斗，但仍不敌阿尔萨斯。阿尔萨斯摧枯拉朽般地击溃了精灵的部队，顺利进入了太阳之井。作为展示他的力量的手段，他把希尔瓦娜斯的遗体变成女妖，使她永远不死，永远向阿尔萨斯这个奎尔萨拉斯的征服者效忠。
最后，阿尔萨斯把克尔苏加德的尸骨浸没在太阳之井的圣水中。尽管永恒的圣水因此受到了污染，克尔苏加德却复活成为了一个法力强大的巫妖，重获新生之后的克尔苏加德向阿尔萨斯解释了巫妖王的下一步计划。当阿尔萨斯和他的亡灵军队挥师南下时，奎尔萨拉斯已是死寂沉沉。屹立了九千多年的高等精灵的王城从此不复存在。
37阿克蒙德的归来和卡利姆多之旅
克尔苏加德复活之后，阿尔萨斯就率领亡灵天灾杀向了达拉然。他们要在那里得到麦迪文之书，然后用它来召唤阿克蒙德，然后阿克蒙德将亲自率领燃烧军团发起最后的进攻。就连肯瑞托的法师也无法阻止阿尔萨斯的军队偷到麦迪文之书。很快，克尔苏加德就凑齐了施展魔法所需的物品。在距第一次入侵艾泽拉斯世界失败的一万年后，强大的恶魔阿克蒙德和他的部队再次浮现在艾泽拉斯世界的上空。然而，达拉然并不是他们的最终目标。在基尔加丹的命令下，阿克蒙德和他的恶魔跟随亡灵天灾到达了卡利姆多，他们计划要摧毁世界之树——诺达希尔。
在这场混乱当中，一个孤独而神秘的预言者给危难之中的弱小种族提供了指引。这个预言者不是别人，正是最后一位守护者，麦迪文，他正在努力挽救自己犯下的错误。麦迪文告知兽人部落和人类联盟，危险就在眼前，双方应该即刻联合起来。但是由于世代交恶，他们是不可能合作的。麦迪文不得不分别警告兽人和人类，即便是使用预言术或者欺骗的手段，也要引导他们渡过大海，前往传说中的大陆——卡利姆多。兽人和人类很快就遇到了隐居很久的卡多雷文明。
萨尔领导兽人经历了千辛万苦，在卡利姆多的荒地上展开了探索。尽管友善的牛头人凯恩·血蹄和强壮的牛头人战士慷慨相助，很多兽人还是开始屈服于折磨他们多年的杀戮欲。萨尔的副官——格罗姆·地狱咆哮——甚至背叛了兽人部落，屈服于这种由恶魔带来的欲望。格罗姆·地狱咆哮和他的战歌氏族在灰谷遇到了远古暗夜精灵的哨兵。在确认兽人再次显示出了他们好战的本性之后，半神塞纳留斯亲自前来驱逐这些兽人。然而，地狱咆哮和他的手下被无尽的仇恨和愤怒所控制，杀死了半神塞纳留斯，玷污了古老的森林。最后，地狱咆哮帮助萨尔打败了玛诺洛斯——这个当初利用自己充满仇恨和愤怒的鲜血诅咒兽人的恶魔领主，赢回了自己的荣誉。随着玛诺洛斯的死去，兽人也从恶魔的诅咒中永远解脱了出来。
当麦迪文劝说兽人和人类组成联盟的时候，暗夜精灵依靠他们的力量独力对抗着燃烧军团。暗夜精灵的大祭司泰兰德·风语者独立奋战，将恶魔和亡灵抵挡在灰谷外。泰兰德也感到她需要援兵，于是，她前去唤醒沉睡了千年的德鲁伊们。有了爱人玛法里奥·怒风的帮助，泰兰德成功地加强了防御，击退了燃烧军团。大自然在德鲁伊的帮助下击溃了燃烧军团和亡灵天灾。
在寻找更多沉睡的德鲁伊时，玛法里奥发现了关押他的亲生兄弟伊利丹的石牢。泰兰德相信伊利丹将助他们一臂之力，于是就把他释放了出来。虽然伊利丹确实帮助了他们一段时间，但他最终还是走上了自己的道路。
暗夜精灵团结一心，坚决抵抗燃烧军团。然而燃烧军团一刻也没有停止过对永恒之井的渴望，始终妄想得到世界之树的力量。如果他们的计划得逞，世界将在这群恶魔的手中彻底毁灭。
38背叛者的胜利
在燃烧军团对灰谷展开入侵期间，伊利丹结束了他在地牢中近万年的囚犯生涯。他曾尽力让他的伙伴对他安心，但很快他就原形毕露，吸收了一个被称为“古尔丹之颅”的强大术士神器的能量。完成吸收之后的伊利丹变化成了一个拥有恶魔外表和强大力量的生物，他还获得了古尔丹的一部分记忆，特别是关于萨格拉斯之墓——那座传说中位于一座小岛上的，埋藏着黑暗泰坦萨格拉斯遗骸的地牢。
重新获得力量和自由的伊利丹急于证明自己的价值。然而他碰上了基尔加丹，这个恶魔向他提出了一个难以抗拒的提议。基尔加丹对阿克蒙德在海加尔山的失败非常恼火，不过他还有比复仇更重要的事情要做。在觉察到自己的杰作巫妖王变得过于强大而难以控制之后，基尔加丹命令伊利丹去终结耐奥祖，并永远消灭亡灵天灾的力量。作为交易的条件，伊利丹将会得到巨大的力量并在燃烧军团的领导者中占有一席之地。
伊利丹同意了这个计划，并立刻开始准备摧毁囚禁着巫妖王灵魂的冰晶块：冰封王座。伊利丹知道他需要一件强大的神器来摧毁冰封王座，于是他准备用从古尔丹的记忆中得到的知识去寻找萨格拉斯之墓并得到黑暗泰坦的遗物。他将那些蛇一般的那迦从黑暗的深海巢穴中召唤出来。在狡猾的首领瓦辛的带领下，那迦帮助伊利丹寻找传说中萨格拉斯之墓所在的破碎岛屿。
在伊利丹和那迦出发的同时，典狱官玛维·影歌也开始了对他的追捕。玛维在这一万年里一直担任伊利丹的看守，她相信自己可以重新抓获伊利丹。然而，狡猾的伊利丹让玛维和哨兵们的努力化为泡影，并成功窃取了萨格拉斯之眼。伊利丹带着这个强大的神器来到魔法之城达拉然。城市里的能量装置强化了伊利丹的力量，他开始使用萨格拉斯之眼施展一个毁灭性的法术来对付位于遥远的诺森德大陆上的巫妖王。伊利丹的法术粉碎了巫妖王的防御力量并割裂了世界之脊。在最后的时刻，这个毁灭性的咒语被赶来支援玛维的玛法里奥和女祭司泰兰德所阻止。
伊利丹很清楚，基尔加丹绝对不会对他的失败善罢甘休，便逃向荒凉的外域，这里是德拉诺的残留地域，曾经是兽人的家园。伊利丹决定在这里避避风头并计划他的下一步行动。在成功地阻止了伊利丹之后，玛法里奥和泰兰德回到灰谷的家园去照顾他们的人民。然而玛维并不打算善罢甘休，她尾随伊利丹来到外域，下决心要把他带回去接受审判。
39血精灵的崛起
此时，亡灵天灾已将洛丹伦和奎尔萨拉斯彻底变成了充满剧毒的瘟疫之地。那里只有一些小规模的联盟抵抗力量仍在苟延残喘。其中的一个组织主要由高等精灵组成，他们的领导者是逐日者王朝的最后一个成员，凯尔萨斯王子。作为一名出色的法师，凯尔小心翼翼地在几近覆灭的联盟中成长。高等精灵对家园的沦陷非常悲痛，为了向死去的同胞表示敬意，他们改称自己为血精灵。当血精灵奋力遏制亡灵天灾的攻势时，他们因为离开了太阳之井这个力量的源泉而备受煎熬。为了缓解手下们与生俱来的对于魔法的**，凯尔做了件令人无法想象的事情：他接受了他们的高等精灵祖先伸出的援手，怀着找到一个新的魔法力量之源的希望加入了伊利丹和他的那迦部队。残余的联盟领袖谴责血精灵为叛徒，并将他们永远驱逐。
走投无路之下，凯尔和他的血精灵们只得跟随伊利丹来到外域，并帮助他对付典狱官玛维。玛维本已将伊利丹抓获，却被血精灵和那迦联手击败，伊利丹也被重新解放。伊利丹将外域作为自己的基地，为了向巫妖王和他的寒冰皇冠要塞发起新一轮的进攻而聚集着力量。
40瘟疫之地的内战
巫妖王耐奥祖知道自己已经时日不多了。被囚禁在冰封王座之中的他怀疑基尔加丹会派出手下来毁灭自己，伊利丹的咒语造成的伤害破坏了冰封王座，巫妖王的力量因而一天天地丧失。于是，急于自保的耐奥祖将他最强大的手下——死亡骑士阿尔萨斯召唤到身边。
阿尔萨斯的力量随着巫妖王的虚弱而渐渐流失，他陷入了洛丹伦的一场内战中。女妖希尔瓦娜斯·风行者领导着半数的亡灵军团发动了一场试图颠覆阿尔萨斯统治的政变。正当战斗扩散到整个瘟疫之地时，阿尔萨斯被巫妖王所召唤，领导权被移交给了他的副官克尔苏加德。
最终,希尔瓦娜斯和她的亡灵叛军（他们被称作被遗忘者）将洛丹伦都城的废墟占为己有。被遗忘者在都城的残骸下建立起了自己的基地，他们发誓要击败天灾并将克尔苏加德和他的仆从赶出大陆。
力量遭到削弱的阿尔萨斯仍决定去援救他的主人。他到达诺森德后却发现伊利丹的血精灵和那迦已经先他一步到了那里。于是，阿尔萨斯和他的蜘蛛怪只得与伊利丹的部队争夺时间，他要率先到达寒冰皇冠冰川并保护冰封王座。
41巫妖王的胜利
即便是在如此虚弱的情况下，阿尔萨斯最终仍以策略战胜了伊利丹，并率先抵达了冰封王座。阿尔萨斯用他的魔剑霜之哀伤击碎了囚禁巫妖王的冰牢，并得到了耐奥祖附魂的头盔和胸甲。阿尔萨斯将拥有无尽力量的头盔戴到了自己的头上，成为了新的巫妖王。正如耐奥祖一直计划的那样，他和阿尔萨斯的灵魂合体成为一个强大的生物。伊利丹和他的军队被迫耻辱地逃回外域，阿尔萨斯则成了这个世界上最强大的生物之一。
现在的阿尔萨斯作为新的不朽的巫妖王占据着诺森德，据说他正在那里重建寒冰皇冠城堡，而他所信任的副官克尔苏加德则统领着瘟疫之地的天灾部队。希尔瓦娜斯和她的反叛亡灵力量仅仅控制着提瑞斯法林地，那只是被饱经战乱的洛丹伦王国的一小部分。
42古老的仇恨—卡利姆多的开拓
尽管获得了战争的胜利，但艾泽拉斯的各个种族却发现他们的世界早已被战争所摧毁。亡灵天灾和燃烧军团毁灭了洛丹伦的文明，卡利姆多也几乎遭受同样的命运。这里有饱经创伤的森林需要治愈，有无边的仇恨需要忘却，人民需要新的家园来定居。战争重创了每一个种族，但他们无私地合作，想要创造一个新的开端。这一切都从联盟和部落之间极为来之不易的停战开始。
萨尔领导着兽人来到卡利姆多大陆，他们在牛头人同胞的帮助下建立了一个新的家园。兽人们以萨尔被暗杀的父亲的名字将这新的国家命名为杜隆坦，他们定居下来，并试图重建他们那一度辉煌的文明。现在恶魔的诅咒被终结了，部落从一股好战的狂热力量变为了一个松散的联盟，生存与繁荣是他们的首要任务。在高贵的牛头人和狡猾的暗矛部落巨魔的帮助下，萨尔和他的兽人们期盼着一个和平的******的到来。
吉安娜·普罗德摩尔手下残存的联盟力量定居在南卡里姆多。他们在东海岸的尘泥沼泽附近建立了简陋的港口城市塞拉摩。人类和矮人同盟合力在这片充满危险的土地上生存，尽管杜隆坦和塞拉摩的防御力量彼此暂时停战，但这个脆弱的殖民地的平静并不意味着最终的和平。
人类和兽人间的和平被一支抵达卡利姆多的庞大联盟舰队所破坏。海军上将戴林·普罗德摩尔（吉安娜的父亲）率领这支舰队在阿尔塞斯毁灭洛丹伦之前离开了那里。海上数月的航行令人筋疲力尽，但是普罗德摩尔仍然寻找着一切他可以找到的联盟幸存者。
海军上将普罗德摩尔的舰队对该地区的稳定造成了严重的威胁。作为一位在第二次战争中声名显赫的英雄，吉安娜的父亲是部落的死敌，他决心在兽人站稳脚跟之前摧毁杜隆坦。
普罗德摩尔强迫吉安娜做出一个艰难的抉择：支持他对抗兽人并且背叛她的新同盟，或者与她的亲生父亲交战来维护联盟和部落之间来之不易的脆弱和平。在一番思想斗争之后，吉安娜选择了后者，她帮助萨尔打败了她疯狂的父亲。不幸地是，海军上将在吉安娜向他证明兽人已经不再是嗜血的怪物并与他和解之前就战死了。出于吉安娜对部落的忠诚情义，兽人们同意让她的部队安全地回到塞拉摩的家园。
……
就在这一年，我们的男猪脚迪亚戈·阿斯纳尔来到了美丽壮阔的艾泽拉斯。