艾文急忙赶回实验室，召集曾经的团队成员，可惜大部分人都已离世或退休。但他没有放弃，培养新人重新投入研究。他们发现此次病菌极为特殊，隐藏性极强。
正当众人感到绝望时，艾文想到晶体既然能给予一次启示，也许还有更多秘密。于是他再次前往博物馆取出晶体。经过不懈努力，借助晶体的力量，他们找到了病菌的克星。艾文在这场最后的战役中，成功守护了人类，他的名字永远被铭记在人类抗击病菌的光辉史册之上。
艾文去世之后，那颗晶体仍然被妥善保管在博物馆。几十年过去了，新一代的科学家们对晶体展开了更为深入的研究。他们发现晶体除了蕴含病菌防御知识外，似乎还有着某种能量波动。
其中一位年轻科学家露西，大胆猜测这晶体或许与时空穿越有关。在一系列严谨的实验下，竟然真的打开了一道通往远古的小型虫洞。透过虫洞，可以看到尼安德特人生活的景象。
露西决定冒险进入虫洞探究一番。她到达远古后，发现这里的生态环境远比想象的复杂。尼安德特人热情地欢迎她，原来他们早已感知到有人会到来。露西表明来意后，尼安德特人告诉她，晶体其实是他们一族为防止世界遭受灭顶之灾而创造的保险装置，里面还藏有无尽的智慧等待发掘。露西在尼安德特人的帮助下，获取了更多关于晶体的知识。返回现代后，她凭借这些新知识，开启了人类对古文明探索与生命科学研究的新纪元。
露西虽然带回了新知识，但晶体的能量波动开始变得不稳定。她和团队紧急商讨对策，担心会引发不可预知的后果。就在此时，虫洞突然扩大，强大的吸力将实验室里与晶体有关的设备纷纷吸扯进去。露西试图抓住身边的东西稳住身体，但无济于事，也被卷入虫洞之中。
当露西再次恢复意识，发现自己身处一片陌生的远古大陆，周围都是未曾见过的动植物。她四处寻找回去的办法，遇到了一群尼安德特人正在举行神秘仪式。露西走近观察，他们像是在封印什么东西。原来这是阻止晶体能量失控的古老仪式。露西赶忙上前表明身份并寻求帮助。尼安德特人感受到她的善意，同意让她参与仪式。
在双方的共同努力下，晶体能量慢慢稳定，虫洞也随之缩小关闭。露西松了口气，尼安德特人赠予她一件带有特殊标记的信物，希望她如果再遇到类似危机时，可以凭借此物再次得到他们的援助。露西带着感激之情和更多对古文明的领悟回到现代，准备将这段经历分享给科学界同仁。
露西回到现代后，立刻召开了一场盛大的学术研讨会。她详细讲述了自己在远古的所见所闻，包括尼安德特人的生活习性、文化传承以及那场惊心动魄的稳定晶体能量的仪式。
与会的科学家们听得如痴如醉，他们对古文明的兴趣愈发浓厚。然而，在会议结束后的当晚，露西发现那件尼安德特人赠予的信物发出微弱的光芒。她心中一惊，预感到事情不妙。
不久后，各地陆续传来异常现象的报告。一些古老遗址出现神秘的能量波动，似乎与晶体能量的不稳定产生了共鸣。露西明白，这一定与之前虫洞事件有关。
她决定再次借助信物联系尼安德特人。在尼安德特人的远程指引下，露西和她的团队找到了一处隐藏在深海之下的古老遗迹。在这里，他们发现了一个巨大的能量源，正是导致近期种种异常的根源。
经过艰苦的努力，他们依照尼安德特人的建议，成功化解了能量源的危机。此后，人类对待古文明的探索更加谨慎，露西也成为了传奇般的存在，激励着一代又一代的科学家勇敢前行。
多年以后，露西的孙女艾米丽也踏上了科学研究之路，她继承了祖母对古文明探索的热情。一天，在研究祖母遗留下来的笔记时，艾米丽发现了一个未曾被注意的细节，关于尼安德特人信物上的标记可能与某座尚未被发现的远古山脉中的神秘力量有关。
艾米丽组建团队开始探险之旅。历经千辛万苦，他们找到了那座山脉。山中弥漫着奇特的雾气，每走一步都仿佛能听到远古的低语。在山脉深处，他们发现了一座被藤蔓覆盖的巨大石门。门上的符文与信物上的标记相呼应。
当艾米丽将信物放在门上对应的位置时，石门缓缓打开。门内射出一道耀眼光芒，光芒中有无数影像闪烁。这些影像竟是远古时期各个人类物种和平共处、共享智慧的画面。
原来，这是尼安德特人留下的又一个启示，旨在告诫人类不应只关注病菌防御或者科技进步，更应重视不同人种之间和谐共生的理念。艾米丽深受触动，决定将这个发现公之于众，以引导人类走向更美好的未来。
艾米丽公布这个发现后，引起了全球范围的轰动与反思。人们开始重新审视不同种族之间的关系，倡导平等、包容与合作。
然而，并非所有人都认同这一理念。一个名为“回归纯净”的极端组织认为其他人类物种早就该灭绝，智人才是唯一正统，他们企图破坏艾米丽发现的石门及其中的影像资料。
艾米丽得知后，联合各界人士守护石门。在冲突即将爆发之际，天空突然降下奇异光线笼罩石门。那些影像投射到空中，全世界都能看见。人们被这壮观的景象震慑，原本摇摆不定的人心开始倾向于和平共处。
“回归纯净”组织成员看到此景，内心也受到极大冲击。他们中的大多数放下武器，少数顽固分子被逮捕。
经此一事，人类更加珍视不同种族和谐共生的理念，艾米丽也被誉为新时代的精神导师，继续投身于探索古文明奥秘与促进人类团结的伟大事业当中。