瑞士战败的直接原因是他们在战斗初期未能攻下敌方的炮兵阵地，还有威尼斯人的到来。

但导致瑞士失败的另一个原因是他们缺乏纪律和无效的指挥结构。

1515 年，瑞士议会授予每位队长都有决定是否继续战斗或撤退的权力。

这使得瑞士军队无法作为一个整体行动。

指挥系统包括两名被选为总指挥的上尉，除了各个连队的队长外，还有一名由每个州的士兵选出的代表。

这些指挥者将对瑞士军队的行动策略进行投票。

在实践中，这个系统一旦受到考验就崩溃了：上尉决定不进攻，而部队的代表，尤其是乌里、施维茨和格拉鲁斯的代表，决定不顾一切地进攻，为了获得丰厚的战利品。

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马里尼亚诺战役确立了法国铸铜炮和骑兵组合优于瑞士步兵迄今为止所向披靡的方阵战术。

法国在马里尼亚诺的成功最终激发了分裂的意大利半岛上的反对力量，改变了欧洲的权力平衡。

与此同时，弗朗西斯获得了米兰城，更重要的是，获得了城内的斯福尔扎城堡，这是控制伦巴第的战略关键。

在那里，马西米利亚诺·斯福尔扎和他的瑞士雇佣军以及锡昂（Sion）的红衣主教撤退，直到法国工兵在城堡地基下放置炸药时才投降。

法国重新夺回了米兰，马西米利亚诺却带着30,000杜卡特金币过上了奢华的流亡生活。

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这场战役彻底结束了瑞士对米兰的雄心，瑞士联邦再也没有与法国或米兰开战。

实际上，自1525年以来，瑞士联邦再也没有参与过战争（除了1536年，伯尔尼州单独征服沃州），也没有对外敌实施过任何军事攻势。

瑞士历史学界往往将这一现象归因于在马里尼亚诺战役所得到的“教训”，但同样有效的是，瑞士宗教改革在1520年代造成的分裂，使联邦内部形成两个派系，彼此间发生内讧，这一局面持续到了欧洲宗教战争期间。

此外，在1515年至1525年间，瑞士雇佣军团经历了多次痛苦的失败（如比科卡、塞西亚和帕维亚战役）。

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经过长时间的谈判，十三个州及其盟友与法王兼米兰公爵弗朗西斯之间的和平条约于1516年11月29日在弗里堡签署。

该条约被称为“永久和平”（Ewiger Frieden, Paix perpétuelle），瑞士联邦放弃了对米兰保护权的所有主张。

作为回报，法国向瑞士联邦支付了70万克朗作为赔偿。

双方同意不向另一方的敌人提供任何支持（先前存在条约的除外），并同意在未来发生争议的情况下安排仲裁。

法国还提出，如果瑞士愿意放弃其跨山地区的领土（贝林佐纳除外），将再支付30万克朗，但该提议被拒绝。

该条约还授予瑞士人在米兰和里昂的贸易特权。

只有奥索拉山谷被归还米兰，而瑞士邦联的其他跨山辖区至今仍是瑞士的一部分，自1803年起成为提契诺州（同时，三个联盟在1797年失去了对瓦尔泰利纳的控制）。

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与法国的“永久和平”确实在法国王国存续期间得以维持。

直到 1798 年法兰西共和国入侵瑞士的法国大革命战争期间才被打破。

在接下来的三个世纪里，它开启了瑞士邦联与法国之间密切联系的时期（与此同时，瑞士摆脱了与神圣罗马帝国的联系）。

与法国和解的下一步是 1521 年与法国签订的服务条约 （Soldbündnis），该条约使瑞士雇佣兵团成为法国军队的常规组成部分

这一安排也持续了三个世纪，四个瑞士团参与了1812年拿破仑对俄罗斯的入侵。

直到1848年瑞士成为联邦制国家，瑞士公民的外国军事服务才被最终禁止。