当埃及苏丹萨利赫·阿尤布（as-Salih Ayyub）去世后，权力短暂传给了他的儿子图兰沙（al-Muazzam Turanshah），随后是他最宠爱的妻子沙加尔·阿尔-杜尔（Shajar al-Durr），大多数历史学家认为她是突厥人，另一些人则认为她是亚美尼亚人。

她在马穆鲁克的支持下掌握了权力，并对法国人发动反攻。

巴赫里指挥官拜巴尔斯（Baibars）的部队击败了路易的军队。

国王因拖延撤退太久，被马穆鲁克在1250年3月俘虏。

他同意支付40万里弗尔图尔货币（livres tournois）作为赎金（其中15万里弗尔从未支付）。

由于当时对男性领导人的政治压力，沙加尔与马穆鲁克指挥官艾拜克（Aybak）结婚。

他后来在浴室中被暗杀。

在随后的权力斗争中，摄政王库图兹（Qutuz）接管了政权。

他正式建立了马穆鲁克苏丹国及巴赫里马穆鲁克王朝。

第一个马穆鲁克王朝以“巴赫里”命名，来源于其中一个军团——“巴赫里亚”（Bahriyyah）或河岛军团（River Island regiment）。

这一名字指的是他们在尼罗河罗达岛（Rhoda Island）的基地。

该军团主要由基普查克人（Kipchaks）和库曼人（Cumans）组成。

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当蒙古帝国的军队在1258年由旭烈兀汗（Hulagu Khan）攻陷巴格达并向叙利亚推进时，马穆鲁克埃米尔拜巴尔斯（Baibars）离开大马士革前往开罗。

在那里，他受到苏丹库图兹的欢迎。

在攻占大马士革后，旭烈兀要求库图兹投降埃及。

库图兹将旭烈兀的使者处死，并在拜巴尔斯的帮助下调动了他的军队。

当蒙古大汗蒙哥汗（M?ngke Khan）在与南宋的战斗中阵亡后，旭烈兀撤走了他的大部分军队回国参加库里台（kurultai，葬礼仪式）。

他留下了副手、基督徒基特布卡（Kitbuqa），并给他派了一支约1.8万人的小分队作为驻军。

马穆鲁克军队由库图兹率领，在奥龙特斯河（Orontes River）附近设下埋伏，击溃了兵力减少的伊尔汗国（Ilkhanate）军队，并在1260年的艾因贾卢特战役（Battle of Ain Jalut）中擒获并处决了基特布卡。

在这场伟大的胜利之后，库图兹被策划谋杀的马穆鲁克所刺杀。

人们普遍认为拜巴尔斯参与了暗杀阴谋。

随后数个世纪中，马穆鲁克断断续续地统治，平均每位苏丹的统治时间只有七年。

马穆鲁克第二次在霍姆斯（Homs）第一次战役中击败了伊尔汗国，并开始将他们向东驱逐。

在此过程中，他们巩固了对叙利亚的控制，加强了该地区的防御，并在当地王子之间建立了邮件路线和外交联系。

拜巴尔斯的部队在1263年袭击了阿克里（Acre），1265年占领了凯撒利亚（Caesarea），并在1268年攻陷了安条克（Antioch）。

马穆鲁克也在1271年和1281年（第二次霍姆斯战役）击败了伊尔汗国对叙利亚的新一轮进攻。

然而，他们在1299年的瓦迪·哈赞达尔战役（Battle of Wadi al-Khazandar）中被伊尔汗国及其基督教盟友击败。

不久之后，马穆鲁克在1303/1304年和1312年再次击败了伊尔汗国。

最终，伊尔汗国和马穆鲁克在1323年签署了和平条约。