在1545年离开城市进行“最后”的海军远征，期间轰炸了西班牙本土的港口，并最后一次登陆马约卡（Majorca）和梅诺卡（Menorca）。

随后，他返回君士坦丁堡，在博斯普鲁斯海峡（Bosphorus）建造了一座宫殿，位于今天萨瑞耶尔（Sar?yer）区的比尤克德雷（Büyükdere）。

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海雷丁·巴巴罗萨于1545年在君士坦丁堡退休，将阿尔及尔的接任权交给他的儿子哈桑·帕夏（Hasan Pasha）。

随后，他开始向穆拉迪·锡南·雷伊斯（Muradi Sinan Reis）讲述自己的回忆录。

这些回忆录由五卷手稿组成，称为《海雷丁·帕夏的征服》。

如今，这些手稿在托普卡匹皇宫（Topkap? Palace）和伊斯坦布尔大学图书馆（Istanbul University Library）展出。

它们由巴比阿里文化出版公司（Bab?ali Kültür Yay?nc?l???）整理并出版，名为《舰长帕夏的航海日志》（Kaptan Pa?a"n?n Seyir Defteri），作者为土耳其学者阿赫梅特·希姆希尔吉尔教授（Prof. Dr. Ahmet ?im?irgil）。

此外，这些回忆录也被改编为小说《地中海是我们的》（Akdeniz Bizimdi），作者为M.埃尔图鲁尔·迪兹达（M. Ertu?rul Düzda?）。

巴巴罗萨还是米卡·瓦尔塔里的小说《流浪者》（The Wanderer，1949年）中的主要角色之一。

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在1546年7月，海雷丁·巴巴罗萨在博斯普鲁斯海峡（Bosphorus）上的宫殿中去世，周围是那条曾多次将他的战船冲向爱琴海的湍急河流。

海雷丁是因一场常见于夏季的热病去世，享年六十三岁。

而法国人却恶意的报告为“他因后宫的种种恶习而精疲力竭”。

“即便在伟大的希腊和罗马征服者之中，也没有一个能与他相提并论，”阿贝·德·布朗托姆（Abbe de Brantome）写道。

由于阿贝是圣约翰骑士团（Knights of St. John）最为仇视的敌人之一，这一赞誉显得更加令人信服。

海雷丁·巴巴罗萨不仅是一位伟大的战士——土耳其人一直尊同这一点——而且还是当时的第一海员。

此外，凭借着他的勤奋、毅力和耐心，他建立了一个将持续数百年的伟大王国。