回到飞船后，艾米丽终于修复了通讯系统的部分功能。“我可以尝试发送简短的信号，希望总部能收到。”艾米丽说道。

她迅速发送了关于微生物蛋白质和细菌能量结构体弱点的信息。联盟总部收到这些信息后，立刻展开了研究。

林娜看着数据说道：“这是个重要的突破，我们要尽快根据这些信息研发出相应的对策。”

工程师们开始尝试根据蛋白质的结构合成一种可用于大规模防护的材料，而科学家们则进一步研究如何利用细菌能量结构体的弱点来改进防御武器。

在被感染天体上，探险队成功提取了足够的蛋白质，并制成了一种简易的防护屏障。他们将屏障安装在飞船和机器人周围，再次面对黑色物质能量波时，发现防护屏障起到了一定的作用，能量波对他们的冲击明显减弱。

“太好了，我们有希望了！”队员们欢呼起来。

但好景不长，随着时间的推移，黑色物质似乎察觉到了他们的防御手段，能量波的频率和强度再次发生变化，开始逐渐适应防护屏障的防护机制。

“它们又在适应了，我们得继续改进。”卡尔担忧地说。

就在这时，联盟总部传来消息，他们已经根据探险队的信息研发出了一种新型的防护喷雾和武器升级方案。防护喷雾中含有合成的类似蛋白质物质，可以在大面积区域形成防护层。武器升级方案则是让太空清洁机器人能够更精准地攻击细菌能量结构体的弱点。

探险队收到物资后，立刻对飞船和机器人进行了防护和武器升级。再次面对微生物的攻击时，他们发现防护喷雾形成的防护层能够有效抵御能量波，机器人的攻击也能更有效地破坏细菌的能量结构体。

然而，在他们逐渐控制局面的时候，被感染天体内部突然出现了一股更强大的能量波动。这股波动似乎来自天体的核心，整个天体开始剧烈颤抖，黑色物质像是被激怒了一般，疯狂地向探险队涌来。

“这是怎么回事？难道还有我们没发现的东西？”杰克震惊地看着眼前的景象。

卡尔脸色苍白：“也许这是整个天体的防御机制，我们触动了它的底线。”

探险队和太空清洁机器人全力抵抗，但黑色物质的数量太多，它们不断冲击着防护层，防护层的能量在快速消耗。

“我们不能这样下去，得想办法进入天体内部，看看能不能从根源上解决问题。”艾伦提出了一个大胆的建议。

杰克思考了片刻，然后下定决心：“好，我们准备进入天体内部，但这可能是一条有去无回的路。大家做好准备了吗？”队员们纷纷点头，眼神中充满了坚定。

他们驾驶着飞船，向着天体内部进发，一路上冲破黑色物质的重重阻碍。而在他们身后，被感染天体周围的宇宙空间已经陷入了一片混乱，微生物和黑色物质的能量波动影响了附近的天体和星系，联盟的其他防御力量也在紧张地应对着这一连锁反应。探险队的行动成为了这场宇宙危机的关键，他们能否在天体内部找到解决问题的方法，宇宙的命运在此刻全系于他们身上，而前方等待他们的是更深的黑暗和未知的危险，就像宇宙在无声地考验着人类的勇气和智慧。