经过连番的战斗和危机，宇宙联盟虽然遭受了重创，但也在困境中展现出了顽强的生命力。夜影和鬼医等人深知，此时正是重建联盟、提升实力的关键时刻。

夜影首先对联盟内部的结构和制度进行了改革，加强了权力的制衡和监督，确保类似的叛乱不再发生。同时，他大力提拔了一批在战斗中表现出色、忠诚勇敢的成员，为联盟注入了新的活力。

鬼医则专注于医疗和科技研发方面。他带领团队深入研究遗迹中获取的技术，不仅成功改进了治疗方法，还开发出了一系列新型的武器和防御装备。

在资源分配上，联盟重新规划了各个星球和文明的职责，实现了更加高效的合作与互补。同时，他们积极开展与其他友好文明的交流与贸易，不断扩充联盟的资源储备。

艾拉和汤姆被委以训练新兵的重任。他们将自己的战斗经验毫无保留地传授给新一代的战士，培养出了一支支精锐的部队。

然而，和平的时光并没有持续太久。在宇宙的边缘，一个被称为“暗影帝国”的强大势力逐渐崛起。他们拥有着先进的科技和庞大的军队，对周边的文明展开了疯狂的侵略。

“暗影帝国”的触角很快伸向了宇宙联盟。他们派出使者，向宇宙联盟发出威胁，要求其归顺或者被毁灭。

夜影毫不犹豫地拒绝了他们的无理要求：“宇宙联盟绝不屈服于任何邪恶势力！”

于是，一场新的战争迫在眉睫。

为了应对“暗影帝国”的威胁，宇宙联盟开始了紧张的备战。夜影制定了详细的战略计划，决定主动出击，打乱敌人的部署。

在一次秘密行动中，夜影带领一支精锐小队潜入了“暗影帝国”的后方。他们成功摧毁了敌人的重要补给线，为正面战场创造了有利条件。