与此同时，科研团队根据在堡垒内获取的资料，结合之前对生命种子的研究，终于找到了“启动密钥”的具体线索。原来，“启动密钥”并非是一个实体物品，而是一种特定的能量频率组合，这种组合能够激活生命种子中隐藏的力量，进而对抗黑暗势力试图唤醒的古老邪恶力量。

联盟总部得知这一消息后，立即命令科研团队尽快研发出能够产生这种特定能量频率组合的设备。同时，远征军在堡垒内继续搜寻关于黑暗势力计划的更多信息，以便制定下一步的应对策略。

在堡垒内部的深入探索中，联盟部队发现了一些隐藏的实验室和数据存储中心。在这些实验室中，他们找到了大量关于黑暗势力对各个文明进行控制和改造的实验记录，以及他们唤醒古老邪恶力量的详细计划。通过对这些资料的分析，联盟了解到黑暗势力计划在一个特定的宇宙时间节点，利用遍布宇宙的能量网络，将所有收集到的黑暗能量汇聚到一起，从而唤醒沉睡在宇宙深处的古老邪恶力量。

而这个宇宙时间节点已经越来越近，留给联盟的时间不多了。联盟总部迅速做出决策，一方面加快研发能够产生“启动密钥”能量频率组合的设备；另一方面，继续加强对黑暗势力的军事打击，破坏他们构建能量网络的其他关键节点，延缓他们唤醒古老邪恶力量的计划。

联盟远征军在黑色堡垒内与黑暗势力的残余力量展开了最后的清剿行动。经过一番激烈的战斗，他们成功控制了黑色堡垒，并摧毁了堡垒内与能量网络相关的关键设施。随后，远征军兵分多路，前往黑暗势力在其他区域构建的能量网络节点，展开全面的破坏行动。

在科研基地，伊芙琳和她的团队经过日夜奋战，终于成功研发出了能够产生“启动密钥”能量频率组合的设备——“秩序共振器”。这个设备外形如同一个巨大的水晶塔，内部集成了最先进的能量转换和频率调制技术。

联盟立即将“秩序共振器”运往各个关键战场，并开始在生命种子周围部署相关的能量引导装置。当“秩序共振器”启动时，一道道绚丽的能量光束射向生命种子，与生命种子中的基因编码产生了强烈的共鸣。生命种子开始释放出一种纯净而强大的光芒，这种光芒逐渐蔓延开来，形成了一个巨大的能量场。

在能量场的作用下，黑暗势力构建的能量网络开始受到干扰，部分节点出现了能量紊乱的现象。联盟远征军抓住这个机会，对各个能量网络节点发动了更加猛烈的攻击。在联盟的全力打击下，黑暗势力的能量网络逐渐土崩瓦解。

然而，黑暗势力并不打算就此放弃。他们察觉到了联盟的计划，开始集中所有剩余力量，试图阻止联盟启动“秩序共振器”。一场决定宇宙命运的最终对决在宇宙的舞台上拉开了帷幕。黑暗势力的庞大舰队如乌云般向联盟舰队和“秩序共振器”所在的区域涌来。

联盟舰队迅速组成防御阵型，将“秩序共振器”严密保护在中间。双方舰队在宇宙空间中展开了一场史无前例的激战。黑暗势力的战舰发射出各种奇异的黑暗能量光束，试图突破联盟舰队的防线；联盟舰队则凭借着先进的武器和紧密的配合，顽强地抵御着黑暗势力的攻击。

在激烈的战斗中，联盟舰队的一些战舰不幸被敌方击中，壮烈牺牲。但其他战舰毫不退缩，继续奋勇作战。宇宙文明的战舰发射出强大的粒子束，对黑暗势力的舰队进行大面积打击；星灵族的灵能者们释放出更为强大的心灵风暴，干扰黑暗势力的战舰操控和指挥系统；影族联盟的战舰则利用空间扭曲技术，在敌方舰队中制造出混乱和破绽。

随着战斗的持续进行，联盟舰队逐渐占据了上风。但就在此时，黑暗势力启动了一种禁忌武器，一道巨大的黑暗能量柱从他们的旗舰中射出，直奔“秩序共振器”而去。在这千钧一发之际，联盟舰队的指挥官果断下令，所有战舰集中火力对黑暗能量柱进行拦截。同时，星灵族的灵能者们将全部精神力量汇聚在一起，形成了一道强大的心灵护盾，试图阻挡黑暗能量柱的前进。

在联盟舰队的全力抵抗下，黑暗能量柱的前进速度逐渐减缓。最终，在“秩序共振器”即将被击中的瞬间，黑暗能量柱被成功拦截。联盟舰队抓住这个机会，发动了最后的总攻。在联盟舰队的猛烈攻击下，黑暗势力的舰队终于全面溃败。

随着黑暗势力舰队的瓦解，“秩序共振器”成功启动了生命种子中隐藏的力量。一道耀眼的光芒从生命种子中爆发出来，迅速蔓延至整个宇宙。在这道光芒的照耀下，黑暗势力试图唤醒的古老邪恶力量被成功压制，宇宙中的黑暗能量逐渐消散。

联盟取得了这场宇宙战争的最终胜利，宇宙再次恢复了和平与秩序。在这场艰苦卓绝的战斗中，联盟的各个文明紧密团结，充分发挥各自的优势，共同战胜了强大的黑暗势力。

战后，联盟在宇宙中举行了盛大的庆祝活动，各个文明的代表齐聚一堂，共同庆祝这来之不易的胜利。同时，联盟也开始着手重建和发展工作，加强对宇宙的探索与研究，以防止类似的危机再次发生。

在这场波澜壮阔的宇宙博弈中，联盟不仅展现出了强大的实力和坚定的信念，更让整个宇宙看到了团结与合作的力量。从此，联盟成为了宇宙和平与秩序的守护者，引领着各个文明走向更加繁荣和美好的未来。