随着联盟大军的加入，艾丽等人压力骤减。他们抓住时机，与银河护卫队协同作战，再次向神秘组织的指挥舰发起攻击。艾丽借助净化光剑的力量，在空中几个翻身，接近指挥舰护盾薄弱处，将光剑狠狠刺入。护盾瞬间出现一个缺口，队员们见状，立刻将手中的“晶核穿甲弹”掷入缺口。只听一声巨响，指挥舰内部发生剧烈爆炸，火光冲天，缓缓坠向地面。

失去指挥舰的调控，神秘组织的士兵们更加混乱，战斗力大减。联盟大军乘胜追击，逐步将敌人逼退。然而，神秘组织首领怎肯轻易认输，他亲自驾驶一艘巨型黑暗战舰，从后方杀出。这艘战舰全身笼罩在浓厚的黑暗能量之中，船头的主炮能发射出威力巨大的黑暗能量炮，所到之处，联盟军的战舰护盾纷纷破碎，陷入危机。

“集中火力攻击首领战舰！”林奇大声下令，联盟军战舰纷纷调转炮口，全力向首领战舰射击。但战舰周围的黑暗能量太过强大，普通攻击根本无法穿透。

关键时刻，卡尔带领科研团队操控着“光子冲击炮”赶到战场前沿。这门炮能释放出强力净化光波，是神秘组织黑暗能量的克星。“光子冲击炮”充能完毕，一道耀眼的白色光波如利剑般射出，直直冲向首领战舰。黑暗能量与净化光波在空中激烈碰撞，发出震耳欲聋的巨响，光芒刺得人几乎睁不开眼。

在净化光波的持续冲击下，首领战舰周围的黑暗能量逐渐消散，战舰的防御出现破绽。联盟军战舰抓住时机，主炮齐鸣，一连串的攻击命中首领战舰。战舰多处受损，冒出滚滚浓烟，飞行姿态变得摇摇晃晃。

神秘组织首领见大势已去，恼羞成怒，他倾尽战舰剩余能量，准备发动最后一击，妄图与联盟军同归于尽。

“快躲开！”林奇惊呼，联盟军战舰迅速分散规避。但仍有几艘战舰躲避不及，被黑暗能量击中，瞬间爆炸起火。

艾丽见状，心急如焚。她深知此刻若不阻止首领，联盟军必将遭受重创。她集中精神，调动体内源自水晶塔的神秘力量，双手向前推出，一道强大的净化光束从掌心涌出，射向首领战舰。净化光束与黑暗能量相互抵消，首领战舰的最后一击被成功化解。

随着首领战舰失去战斗力，神秘组织残余部队彻底崩溃，四散逃窜。联盟军并未就此罢休，乘胜追击，力求将神秘组织一网打尽。

这场生死较量，终于在联盟军的浴血奋战下画上句号。曙光星再次迎来和平，宇宙重归安宁。艾丽望着远去的敌影，心中满是感慨。她知道，这一路艰辛无比，但只要守护宇宙和平的信念不灭，曙光必将永远在前……