而妖族残余势力此时正因为首领东皇太一的陨落而惶恐度日呢，结果这时看到女娲娘娘不计前嫌再次出手庇护他们，因此这些剩余的妖族便纷纷跪求女娲娘娘，希望女娲娘娘可以永久保护他们。

女娲娘娘出于对妖族的保护，也出于自己处在孤掌难鸣境地的考虑，便答应了妖族的请求，直接创立妖教统帅天下万妖，与三清西方二圣分庭抗礼。

女娲娘娘虽然是天道圣人，以前也并没有执政的经验，但是一旦干起来了，那也是有几把刷子的。

在她的执政下，妖族改变了策略，首先主动与巫族修好，随后以妖教立足对抗人族，最后休养生息，慢慢恢复妖族之力。

至此女娲娘娘执掌的妖族才算彻底稳固，其中有生力量包含了以鲲鹏、英招、计蒙、毕方、穷奇、开明、陆吾、饕餮八大妖神为首的残余洪荒力量，同时还包含了以彩凤、金羽、彩鹊、青鸾、火凤、白虎等凤凰鸟兽一族为辅的新生力量。

此外还有兵角共三千七百万余，大舰百万艘，各种灵药，法器，雷火球珠，神雷冲，元磁筒，烈火旗门，玄阴弓箭，铠甲，麒麟战兽，白虎战兽，万里穿云战兽，等等不计其数。

至于东皇第十子则化身为陆压道人，他取之前的夸父、后羿精气于一葫芦中，日夜修炼祭化，终于喜得重宝斩仙飞刀，并借此威震三界，此外再加上女娲娘娘有意无意的照顾，陆压道人活的倒是潇洒无比。

虽然世界在这一刻是安定了，但是天庭却是陷入了无主的状况，在这样的情况下，三清联手推举鸿钧身边的童子（昊天）为天庭玉帝、童女（瑶池）为天庭王母，就这样天庭进入了昊天大帝和瑶池金母统领的时代。

昊天瑶池的确会来事，统治天庭后，他们事事以三教为先，事事以女娲娘娘等天道圣人为先。

就这样新的天庭在纷乱复杂的三界中算是彻底稳固下来了。

只是在天庭统治初期，此时的人间界仍存在着一些大巫部落，他们视妖族、人类为死对头（人为女娲所造，加上老子抢分人道、强立人教之前，人道妖道，合为一体，曾加入妖族大军攻打巫族），不住进攻两族，所以人间仍大战不休。

特别是九黎部落蚩尤举部落之力，以巫族秘术造十二都天神煞大阵，欲聚十二祖巫之灵为己所用。

但人教大兴，轩辕拜师于广成子（广成子为阐教十二金仙之首），广成子助轩辕对抗蚩尤，同时轩辕又有昊天天帝派九天玄女赠送天书，是以轩辕部落实力快速膨胀，并终灭蚩尤部落，轩辕因为战功显赫而为人皇。

蚩尤战败后，巫族众人痛苦不堪，由于轩辕战蚩尤时，昊天天帝派九天玄女赠送天书支援，于是巫族仅存的几位大巫很是不满，特别是刑天一怒之下攻伐天庭，逆天而行。

刑天大战昊天大帝，结果被昊天大帝一剑斩下头颅，不料刑天怨念太深，冲天的暴戾之气竟然吓跑了昊天天帝。

刑天死后，巫族残余势力便以祖巫强良的妹妹九凤为首领而求生存，随后，人巫两族主张以和为贵，不料巫族首领九凤被颛顼偷袭算计，中了轩辕剑后重伤，逃进了洪荒星空。

在洪荒星空中，九凤恢复伤势，随后打算回到洪荒人间，杀死转世的颛顼，以报被辱之仇。

这时女娲娘娘及时出现，动之以情晓之以理，同时又给九凤赐下不少重宝安抚，九凤这才放弃想法于洪荒星空中修炼。

至此，大千世界中，洪荒时期巫族、妖族两族彻底销声匿迹，不复存在，而世界自此也是结束了洪荒时代，开始了新的时代。