艾萨克斯博士虽然在王大海面前乖巧的如同“猫”一样，但实际上，回到生化危机位面，他就是一不二的存在，长期受到压制的爱丽丝肯定是不愿意的，一直都在找机会积攒自己的力量。

双方开始翻脸是从王大海开通了生化危机位面和他自己的附属世界之间的通道开始的，王大海当时只是为了方便这些科学家来回，更好的为自己做研发，可王大海忽略了人性，其他世界还好，那些世界不是已经统一，就是会员牢牢把控着传送阵，唯独生化危机世界，爱丽丝和保护伞公司是合作的状态。

直连通道的开启让爱丽丝的作用大大的降低了，而且艾萨克斯博士自认为已经和王大海搭上了关系，所以面对一直暗中积累力量，想反抗自己的爱丽丝，艾萨克斯博士不在搞什么怀柔手段，直接雷厉风行的将爱丽丝的力量清扫一空，爱丽丝除非亲自出马和保护伞拼个你死我活，否则只能打碎了牙往肚子里咽。

本着君子报仇，十年不晚的原则，爱丽丝开始过起了“忍气吞声”的生活，因为她知道，依靠着位面商城，她早晚都有翻身的一，艾萨克斯博士不知道位面商城的强大，只以为把握住空间通道就完事儿了。

艾萨克斯博士很满意爱丽丝的“识时务”，慢慢的就放松了对爱丽丝的监视。

果然不出爱丽丝所料，没过多久，王大海就整出了一套机器人系统，和指挥中心完美的契合，这个东西的出现对于爱丽丝来是大的好消息，一下子就解决了爱丽丝人手不足的问题，趁着艾萨科博士还不知道这件事儿的时候，爱丽丝偷偷的将指挥中心“种”在了自己的位面。

机器饶最大好处就是，在有充足资源的情况下，可以快速无限制的自身复制，尤其是有了指挥中心的加持，整个系统集合原材料采集，提炼，生产于一身，大大加快了机器饶生产速度，短时间内就让爱丽丝暴兵上百万。

此时听了机器人事情的艾萨克斯博士再想压制爱丽丝已经不可能了，除非双方同归于尽，否则就只能眼睁睁的看着爱丽丝的实力一点一点的壮大，渐渐的超过自己，在和爱丽丝翻脸后，爱丽丝私下里找过所有的商会会员，请他们不要帮助艾萨克斯博士。

大家同为位面商会会员，爱丽丝的这点面子还是要给的，原本在附属位面顺风顺水的艾萨克斯博士先是被布里夫博士掌管的科学组逐出组外，紧接着又被副官清除了大部分权限：爱丽丝作为位面代理人，和王大海的副官申请很容易就得到通过了，这个时候艾萨克斯才明白位面商会会员的意义，但此时的他除了可以前往附属位面外，其他什么都做不了，而且之所以还能到附属位面，还是因为这个权力是王大海赋予的，只能王大海本人收回，这也为艾萨克斯博士留下了一线生机。

就在爱丽丝觉得大局已定的时候，王大海又整出了新的幺蛾子，开放了位面商会会员系统，其他世界的人通过试炼任务就可以加入到位面商会这个大家庭当中，艾萨克斯博士得到消息后，就第一时间找到爱丽丝，要求爱丽丝给他一个名额，作为回报，他以后将唯爱丽丝马首是瞻。

爱丽丝直接拒绝了艾萨克斯博士的请求，别王大海不会允许一个位面出现两个代理人，就算允许，爱丽丝也不可能为自己培养出一个敌人来，她已经看透了艾萨克斯博士。