金刚狼被带到贼窝，在场的有真理子，银武士，毒蛇，还有一个巨大的银色武士机器人。金刚狼两只手被困住，毒蛇用诡计使金刚狼伸出爪子并将其固定。

机器武士站了起来正准备用武士刀热切掉爪子，这时真理子将固定装置破坏。金刚狼开始反击战斗，这时候雪绪赶到，与毒蛇搏斗并将其重创。

金刚狼继续与机器武士搏斗，武士将金刚狼一只手上的狼爪切了下来。金刚狼处于劣势，这时银武士良心发现，在背后偷袭了机器武士，但同时也被机器武士掐死。

金刚狼砍下了机器武士的头，并将其踹到了楼下，同时雪绪也打死了毒蛇。机器武士活了过来，一下子砍掉了金刚狼的另外三根爪。

危急关头，真理子用砍掉的爪子刺进了机器武士的身体。盔甲打开，里面的人原来是几天前就去世的矢志田，原来他想夺取金刚狼的永生能力。

矢志田没有罢休，用某种仪器吸走了艾德曼金属。而矢志田也变得年轻了。金刚狼怒了，而这时骨爪也长了出来，金刚狼刺死了矢志田，并将其推进海里。

一切结束了之后，在机场，金刚狼和真理子道别，此时真理子已经接手矢志田公司，金刚狼和雪绪上了飞机两人坐着飞机回到了美国。

金刚狼下了飞机，走到安检口时旁边塑料筐里的金属物突然动了起来，这时，一个熟悉的声音出现。是万磁王！

接着周围的一切静止，已经死去的查尔斯教授竟然坐着轮椅出现了。

原来这个时候玻利瓦尔特拉斯克所制造并指挥的新型特种战斗机器人“哨兵”开始了对变种人的猎杀。

哨兵机器人可以检测出任何形式的变种类型，而他们的基因则能够让他们瞬间变换和改造自身，从而击败变种人。

变种人彻底陷入了劣势，经过十年的艰难抵抗。变种人最终还是失败了。

这使得变种人的唯一希望，便是回到过去，在特拉斯克的研究最终导致他们的灭绝之前，改变历史。

利用幻影猫凯蒂的能力，金刚狼罗根穿越时空开始了这个艰辛的旅程。他必须联合年轻的变种人领袖教授，以及他一生的对手万磁王，去找到魔形女，并阻止她刺杀特拉斯克。

金刚狼穿越时空修改历史，哨兵计划取消。从这之后就形成了新的时间线。

天启出生于埃及第一王朝，是地球上最古老、最强大的变种人沙巴泊，曾拥有无数信众，但后来遭人背叛，被人活埋。

几千年后，强大无匹而且永生不朽的天启从数千年的深埋中获释，愤怒的他发现同类不再被视为神祇，他对人类世界充满厌恶，决定摧毁它重造一个新世界。

为了实现自己的野心，天启四处游走，开始搜集他的仆人天启四骑士。因为天启的力量，暴风女、灵碟、天使、万磁王的超能力得到巨幅提升，同时他也计划将他的意识移入教授体内，从而组建一支变种人的军队。