解决了时空风暴的危机后，艾莉丝和联盟的科研团队并没有停下探索的脚步。对神秘能量和“时空之门”的研究仍在紧张进行，他们知道，这些未知力量背后隐藏的危险随时可能再次降临。

一日，艾莉丝在科研室与科学家们探讨最新研究成果时，收到了来自宇宙考古学家团队的紧急通讯。考古学家们声音中满是兴奋与急切：“指挥官，我们在一颗古老星球上发现了一些疑似与神秘势力以及‘时空之门’相关的遗迹，这些遗迹可能蕴含着解开一切谜团的关键线索！”

艾莉丝意识到这或许是一个重大突破，立刻安排好科研室的后续工作，带领一支由科研人员和精锐士兵组成的队伍，跟随考古学家的指引前往那颗古老星球。一路上，艾莉丝满心期待又忐忑不安，她深知这次发现可能会带来前所未有的挑战与机遇。

抵达古老星球后，艾莉丝看到眼前的景象十分震撼。巨大的石质建筑残骸散落在星球表面，虽然历经岁月侵蚀，但仍能看出其曾经的宏伟与神秘。建筑上刻满了各种奇异的符号和图案，与神秘势力基地中发现的符号有着相似之处。

考古学家们早已在遗迹周围搭建好了临时研究基地，见到艾莉丝到来，立刻迎上来介绍情况：“指挥官，我们在初步勘探中发现，这些遗迹的历史非常悠久，远超我们之前的认知。从建筑风格和符号特征判断，它们很可能来自一个远古文明。而且，我们在遗迹内部检测到了微弱的能量波动，与神秘势力研究的神秘能量有着某种微妙的联系。”

艾莉丝走进一处保存相对完好的遗迹内部，这里弥漫着一股古老而神秘的气息。墙壁上的符号在黯淡的光线中闪烁着微弱的光芒，仿佛在诉说着远古的故事。科研人员们迅速展开工作，使用各种先进设备对遗迹进行全方位扫描和分析。

随着研究的深入，他们发现这些符号并非毫无规律，而是构成了一种复杂的文字系统。经过不懈努力，科研团队中的语言学家终于成功破解了部分文字的含义。这些文字记载了远古文明的一段历史：在宇宙诞生之初，存在着多个维度的空间，不同维度之间通过一种神秘的力量相互连接。而这种神秘力量，正是如今神秘势力所追寻的神秘能量。

远古文明曾经掌握了控制这种能量的方法，他们利用“时空之门”在不同维度之间穿梭，获取了强大的力量和知识。然而，过度使用这种力量引发了一场巨大的灾难，不同维度之间的平衡被打破，宇宙陷入了混乱。为了拯救宇宙，远古文明决定封印“时空之门”，并将控制神秘能量的技术和知识隐藏起来。

艾莉丝看着这些破解后的文字，心中思绪万千。她意识到，神秘势力试图打开“时空之门”的行为，极有可能重蹈远古文明的覆辙，引发宇宙的再次混乱。而要彻底阻止神秘势力的阴谋，就必须找到远古文明封印“时空之门”的方法。

就在这时，一名科研人员在遗迹的深处发现了一个隐藏的密室。密室的入口被一块巨大的石板挡住，石板上刻满了复杂的图案和符号。艾莉丝和众人合力，利用战舰上的机械装置移开了石板。

进入密室后，他们看到一个巨大的石台上放置着一个散发着柔和光芒的球体。球体表面刻满了与神秘能量相关的符号，周围环绕着一圈能量波动。当艾莉丝靠近球体时，她感觉到一股强大的力量扑面而来，仿佛在与她的意识进行某种交流。

科研人员们立刻对球体展开研究，他们发现这个球体蕴含着极其庞大的能量，而且似乎具备一种特殊的记忆功能，记录着远古文明封印“时空之门”的详细过程。通过对球体的深入解析，他们得知要封印“时空之门”，需要找到三颗特殊的能量宝石，分别代表着时间、空间和能量的平衡。这三颗宝石被远古文明分散隐藏在宇宙的不同角落。